Das Herzstück der Studienangebote am IJK ist der Master-Studiengang „Journalistik und Kommunikationswissenschaft“, der im Wintersemester 2006/2007 startete und heute im Mittelpunkt der IJK-Angebote steht.

Neben dem deutschsprachigen Master-Studiengang bietet das IJK auch einen englischsprachigen, internationalen Studiengang an: den Erasmus-Mundus-Studiengang „Journalism and Media within Globalisation: The European Perspective“ – ein von der Europäischen Union gefördertes Master-Angebot, bei dem Studierende aus aller Welt an drei europäischen Universitäten ausgebildet werden.

In Zusammenarbeit mit der Hamburg Media School bietet das IJK einen „Master of Arts in Journalism“ an – einen zweijährigen, gebührenpflichtigen Studiengang (6.000 Euro/Jahr plus Studiengebühren an der UHH), der sich an Absolventen richtet, die bereits ein Fachstudium abgeschlossenen haben.

An der Universität Hamburg wirkt das IJK außerdem an folgenden Bachelor-Studiengängen mit: dem BA Politikwissenschaft, dem BA Soziologie (beide am Fachbereich Sozialwissenschaften in der Fakultät für Wirtschafts- und Sozialwissenschaften) sowie dem BA Medien- und Kommunikationswissenschaft an der Fakultät für Geisteswissenschaften.